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故事发生在充满了浪漫气息的绸织高校，作为一名转学生，周围的一切对于青叶陆（宫野真守 配音）来说都充满了新奇。新的同学，新的老师，虽然有些奇怪但十分有趣的学校制度，即使有时候会被调皮的同伴恶作剧，但总的来说，陆在绸织高校的生活还是非常的快乐。 对于高中生来说，校园恋爱是一项不可缺少的美好回忆，在学校里，陆认识了一群… -
“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。 身为帝国王子的鲁路修，为了建立人人平等的世界、让妹妹娜娜丽幸福的世界，而使用GEASS，令人绝对服从的力量，带领黑色骑士团…